Ve středověku zde procházela prachatická větev Zlaté stezky – obchodní cesta z Pasova přes Bischofsreut na Volary a do Prachatic. Název osady pravděpodobně pochází ze středověku, kdy zde soumaři putující po Zlaté stezce zastavovali na odpočinek a napájeli zde dobytek z koryt – troub, žlabů nebo žlebů – dřívější název České Trouby, České Žlaby nebo německý název Böhmisch Röhren. První písemné zmínky o osadě jsou až z roku 1709.
Největší rozkvět, ale i největší tragédii zaznamenala tato nejvýše položená osada jižní části Národního parku a chráněné krajinné oblasti Šumava v minulém století. Ve třicátých letech minulého století zde bydlelo přes 1000 obyvatel převážně německé národnosti a byly zde čtyři hostince a hotely s ubytováním, pět obchodů se smíšeným zbožím, pošta s telefonem a telegrafem, finanční stráž, lékař a desítky živnostníků a řemeslníků. Po Mnichovské dohodě z roku 1938 zde zůstali už jen obyvatelé německé národnosti.Po druhé světové válce došlo k odsunu obyvatel německé národnosti, a jelikož je to z Českých Žlebů „jen pár kroků“ do Bavorska, nepřálo osadě ani období poválečné. Kousek za osadou vyrostla železná opona a dosídlení pohraničí se zde prakticky nekonalo. V poválečných letech zde byla zrušena pošta a v roce 1967 byl zbořen i barokní kostel sv. Anny. Dnes je na místě bývalého kostela pouze pamětní kámen, u kterého se každoročně, v období kolem svátku Nanebevzetí Panny Marie, konají česko-německé mše. Ve dříve správní obci, dnes v osadě spadající pod obec Stožec, žije už jen pár desítek obyvatel.